La partie amélioration des plantes vise à faire connaitre à l'étudiant les bases théoriques de l'amélioration des plantes, d'appliquer ces bases à l'amélioration des espèces annuelles et fruitières et de donner les méthodes de sélection utilisables pour ces espèces. En plus, l'objectif principale est de faire comprendre à l'étudiant; d'une part les mécanismes qui régissent la régulation de l'expression des gènes à l'échelle moléculaire aussi bien chez les procaryotes que chez les eucaryotes. d'autres part les différentes techniques utilisées en biologie moléculaire pour la caractérisation des plantes et des agents pathogènes ainsi que les techniques de manipulation de l'ADN.