Microbiologie de l'Environnement L3 Microbiologie S6

Introduction: Notion d’écosystème; place, diversité et spécificité des microorganismes

 

Chapitre I : La microbiologie des eaux

   Les eaux naturelles                

   Les eaux usées

   Les eaux brutes et leur potabilité

 

Chapitre II : La microbiologie du sol

     Spécificité de l’écosystème tellurique

  La microflore du sol : principaux groupements microbiens

  Interactions avec la faune, les eaux et les végétaux

  La fixation d’azote : symbiose légumineuses-Rhizobium

 

Chapitre III : Eléments de microbiologie du tube digestif

 La microflore digestive de l’homme

 La microflore du tube digestif des ruminants

 

Chapitre IV : Contaminations et hygiène des locaux

   Sources de contaminations microbiennes: air, eaux, matières premières, personnel

  Principales contaminations: milieux hospitaliers, milieux industriels

  Règles d'hygiène et normes de sécurité

   Désinfection des locaux

 

Travaux pratiques :

TP N°01 : Détection et isolement des champignons du sol. « Comparaison entre les deux méthodes d’isolements : méthode de suspension-dilutions (dilution plats) et la méthode directe du sol (soil plants de warkup) »

TP N°02 : Observation microscopique des bactéries nodulantes isolées à partir des plantes légumineuses

TP N°03 : Traitement des eaux usées

RESUME

Les micro-organismes sont invisibles à l'oeil nu, et pourtant ce sont des composantes essentielles de tout écosystème. En effet, ils sont présents aussi bien dans l'atmosphère que dans les profondeurs terrestres et ils y exercent des fonctions importantes. Les micro-organismes sont les agents invisibles de fonctions essentielles qu'ils sont seuls à pouvoir assurer :

- ces fonctions sont tellement essentielles que sans leur cortège microbien, les êtres vivants supérieurs, animaux et plantes, ne pourraient pas vivre et se nourrir.

- les micro-organismes assurent, après leur mort, le recyclage des éléments qui composent la matière organique des êtres vivants : ils dégradent les protéines et la cellulose, ils libèrent l'azote, le soufre et le phosphore sous des formes assimilables par d'autres êtres vivants;

- des éléments n'entrent dans les écosystèmes que par l'intervention des micro-organismes : c'est le cas de l'azote, qui n'entre naturellement dans les sols que sous l'action de bactéries spécialisées ;

- ils interviennent aussi dans la formation ou la disparition de composés qui jouent un rôle dans l'effet de serre : méthane, oxydes d'azote;

- enfin, la dégradation de nombreux polluants se fait grâce à l'équipement enzymatique de certains micro-organismes. Des propriétés telles que fertilité, résilience, pouvoir épurateur, attribuées au sol ou au milieu aquatique, sont en fait des propriétés liées à leur microflore. Les micro-organismes sont donc nécessaires pour garantir le fonctionnement équilibré, la fertilité, l'habitabilité et la pérennité de l'environnement où nous vivons.